John Stewart Waugh (* 25. April 1929 in Willimantic, Connecticut; † 22. August 2014) war ein US-amerikanischer Chemiker. Er war ein Pionier in der Kernspinresonanzspektroskopie (NMR-Spektroskopie) und ermöglichte mit anderen deren Erweiterung von Flüssigkeiten auf Festkörper. Dabei arbeitete er sowohl theoretisch als auch experimentell.
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