Das Arrondissement Pontarlier ist eine Verwaltungseinheit des französischen Départements Doubs innerhalb der Region Bourgogne-Franche-Comté. Hauptort (Sitz der Unterpräfektur) ist Pontarlier. Es umfasst 155 Gemeinden aus fünf Kantonen. Mit 1. Januar 2009 wurden die damaligen Kantone Vercel-Villedieu-le-Camp und Pierrefontaine-les-Varans vom Arrondissement Besançon an das Arrondissement Pontarlier übertragen. Der damalige Kanton Le Russey kam vom Arrondissement Montbéliard.