Johann Jakob Scherer (* 10. November 1825 in Schönenberg; † 23. Dezember 1878 in Winterthur) war ein Schweizer Politiker, Offizier und Unternehmer. Ab 1866 gehörte er der Regierung des Kantons Zürich an, ab 1869 dem Nationalrat. Als Vertreter der liberal-radikalen Fraktion (der heutigen FDP) wurde er 1872 in den Bundesrat gewählt. Sechs Jahre später starb er im Amt.
